경부선을 이용하는 대경선의 특성상 지연될 수 있으며, 신암~청도 구간 안전을 위해 서행 운전 조치로 지연될 수 있음을 사전에 고지하고 있는 상황이기에 코레일에서 질문자 분의 수수료를 대신 부담해 주지는 않습니다.
그래도 우선 코레일 측으로 민원은 접수해 보시기 바랍니다(관련해서 검색해보니 수수료를 감면 받았다는 글도 보여지네요).